Van tijd tot tijd worden themanummers van het Vogeljaar uitgegeven. Deze nummers zijn gewijd aan een bijzonder onderwerp. In de loop der jaren zijn bijvoorbeeld themanummers verschenen met titels als dr Jac. P. Thijsse, Jan P. Strijbos, Wilde ganzen, Vogeljacht in Zuid-Europa, Vogels en houtwallen, Hoogstamboomgaarden, Vogels en bosstructuur, De Ortolaan, De Huiszwaluw, De Oeverzwaluw, De Nachtzwaluw, Prof. Voous 70 jaar en De Grauwe Klauwier. In 2011 verscheen een themanummer over de Boerenzwaluw (in het kader van het jaar van de Boerenzwaluw) en in 2013 eentje over de Huiszwaluw.
Verder is in de periode 2002-2006 in het Vogeljaar een reeks van 10 artikelen over de geografische variatie bij ganzen van Leo M.J. van den Bergh gepubliceerd.
© 2007-2022 Stichting Het Vogeljaar. Tijdschrift voor vogelstudie en vogelbescherming.
(voortzetting van Wiek en Sneb.) ISSN 0042-7985.